AME PubMed 实用技巧|PubMed、PMC、MEDLINE 再也不会傻傻分不清

2016-06-02 01:49 来源:AME科研时间 作者:毛智 陈硕
字体大小
- | +

我们刚接触生物医药文献检索的时候,面对 PubMed、PMC(PubMed Central) 和 MEDLINE,经常会产生以下疑惑:

它们到底有什么区别和联系?它们的收录范围有什么区别?它们的检索词有什么各自特点?为什么检索结果数量不同? 平时检索时候用什么数据库更方便?

一、PubMed、PMC 和 MEDLINE 到底有什么区别和联系?

PubMed 诞生于 1996 年。作为目前最常用的文摘型数据库,PubMed 迄今为止已经收录了超过 2500 万条文献记录。其收录范围不仅包括 Medline,还有即将收录至 Medline 的处理中数据、期刊被 Medline 收录但是文章已经优先出版的文献、生命科学期刊出版商提交到 PMC 的文献、NIH 基金资助作者的文献和 NCBI 书籍等。PubMed 还提供链接到文献全文所在网站的全文链接。

久负盛名的 MEDLINE 始建于 1966 年(追溯收录至 1946 年),是美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)期刊文献记录数据库。目前为止,MEDLNE 已经收录超过 5600 种生物医学及生命科学相关学术期刊,文献记录数量逾两千万条。

1983 年,MEDLINE 推出电子版,网上数据每日更新,光盘版每月更新。MEDLINE 有严格的文献选择委员会(the Literature Selection Technical Review Committee ,LSTRC)进行选刊,选刊标准基于 MEDLINE 选刊指南,包括原创性、科学性及全球读者重要性等方面。目前 MEDLINE 的文献都收录在 PubMed 中。

PMC 全称为 PubMed Central,建立于 2000 年,由 NCBI 进行管理,是可以免费获取全文的生物医学和生命科学全文数据库,保存了 NLM 收录印刷杂志的电子副本。PMC 的核心原则是开放获取全文。PMC 并不出版文献,而是收集参与杂志及符合研究资助条件的作者提交文献全文。

二、PubMed、PMC 和 MEDLINE 收录范围有什么区别和联系?

640.jpg

图 1. PubMed、PMC 和 MEDLINE 收录范围图示

PMC 的绝大部分文献都能在 PUBMED 中搜索到,只有一小部分图书评论(book reviews)是没在 pubMed 收录范围内的。

三、PubMed、PMC 和 MEDLINE 检索词有什么各自特点?

MEDLINE 支持主题词检索、字段限定检索、截词检索和自由词检索,需要检索人员根据需要人工选定合适的检索方式进行检索。PubMed 不仅具有 MEDLINE 的检索方式,还可以执行自动匹配(Automatic Term Mapping,ATM)。PMC 也可以进行 PubMed 一样的主题检索、自动匹配检索(ATM)等,但是 PMC 由于收录了全文, 可以额外进行全文检索。

四、PubMed、PMC 和 MEDLINE 为什么检索结果数量不同?

在 PubMed 中自由词检索时,会检索整个 PubMed 的收录范围,其范围大于 MEDLINE。尤其是会有新近半年被收录的文献记录并未被标注 MESH,此时只能用自由词检索到。

当在 PubMed 中限定 MESH 词或 MEDLINE 子集时,其检索结果只会显示 MEDLINE 的数据。

PubMed 收录范围是包括 Medline 和 PMC 数据的,但是我们使用自由词检索的时候 PMC 的检索结果反而更多,这是为什么呢?因为 PMC 收录了全文, 可以额外进行全文检索,所以检索结果较多,这也导致了 PMC 查准率较差。

五、PubMed、PMC 和 MEDLINE,我们该用哪个?

综上所述,三者特点比较如表 1。最适于使用的还是 PubMed,其无愧于当今世界查找生物医药文献利用率最高的数据库。

640.jpg

表 1. PubMed、PMC 和 MEDLINE 的特点总结

六、访问方式:

PubMed:使用下列网址都能访问到

http://www.pubmed.com

http://www.pubmed.org

http://www.pubmed.gov

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Medline:可以在 pubmed 中限定 medline 子集。在 web of science 平台、embase 数据库、ovid 平台也能检索到 medline 的数据。也可以使用 medline 光盘版。

PMC 地址:

http://www.pubmedcentral.com

http://www.pubmedcentral.org

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

参考文献:

1.https://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/medline.html

2.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/about/intro/

3.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3825/

4. 崔雷等.《临床信息管理》. 人民卫生出版社 . 2014

5.http://www.ihep.ac.cn/library/lanmu/library/lanmu/daohang/pubmed.htm

编辑: 任悠悠

版权声明

本网站所有注明“来源:丁香园”的文字、图片和音视频资料,版权均属于丁香园所有,非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明“来源:丁香园”。本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。同时转载内容不代表本站立场。